Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms