Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rtf1A2AQ19 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtf1A2AQ19 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms