Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn3A2ALK8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms