Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ubl3Q9Z2M6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ubl3Q9Z2M6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ubl3Q9Z2M6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ubl3Q9Z2M6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ubl3Q9Z2M6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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