Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn8Q9Z260 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn8Q9Z260 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms