Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Sh3bp5Q9Z131 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Sh3bp5Q9Z131 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Sh3bp5Q9Z131 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Sh3bp5Q9Z131 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Sh3bp5Q9Z131 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Sh3bp5Q9Z131 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Sh3bp5Q9Z131 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Sh3bp5Q9Z131 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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Sh3bp5Q9Z131 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bp5Q9Z131 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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Sh3bp5Q9Z131 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Sh3bp5Q9Z131 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Sh3bp5Q9Z131 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Sh3bp5Q9Z131 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bp5Q9Z131 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms