Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV03

Fam50a, Protein FAM50A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50aQ9WV03 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam50aQ9WV03 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam50aQ9WV03 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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