Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms