Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trpv2Q9WTR1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms