Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms