Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Pdzd4Q9QY39 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Pdzd4Q9QY39 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Pdzd4Q9QY39 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Pdzd4Q9QY39 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Pdzd4Q9QY39 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Pdzd4Q9QY39 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Pdzd4Q9QY39 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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