Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx8Q9QXV1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms