Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms