Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms