Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dclk1Q9JLM8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dclk1Q9JLM8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms