Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms