Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms