Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ClpxQ9JHS4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms