Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
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Rb1cc1Q9ESK9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
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Rb1cc1Q9ESK9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
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Rb1cc1Q9ESK9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
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