Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH3

Vps35, Vacuolar protein sorting-associated protein 35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps35Q9EQH3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps35Q9EQH3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps35Q9EQH3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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