Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms