Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms