Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot8Q9D8X5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms