Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gtf3c6Q9D8P7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gtf3c6Q9D8P7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gtf3c6Q9D8P7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gtf3c6Q9D8P7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gtf3c6Q9D8P7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gtf3c6Q9D8P7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gtf3c6Q9D8P7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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