Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Capns2Q9D7J7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Capns2Q9D7J7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms