Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Borcs6Q9D6W8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Borcs6Q9D6W8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Borcs6Q9D6W8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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