Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rtl8cQ9D6I0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms