Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmtm5Q9D6G9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms