Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Rab11fip1Q9D620 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Rab11fip1Q9D620 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rab11fip1Q9D620 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rab11fip1Q9D620 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rab11fip1Q9D620 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rab11fip1Q9D620 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rab11fip1Q9D620 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rab11fip1Q9D620 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rab11fip1Q9D620 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rab11fip1Q9D620 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11fip1Q9D620 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rab11fip1Q9D620 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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