Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc130Q9D516 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc130Q9D516 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc130Q9D516 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc130Q9D516 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc130Q9D516 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc130Q9D516 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc130Q9D516 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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