Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc83Q9D4V3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms