Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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