Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim42Q9D2H5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim42Q9D2H5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trim42Q9D2H5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trim42Q9D2H5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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