Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pramef12Q9D2F1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms