Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Batf3Q9D275 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Batf3Q9D275 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Batf3Q9D275 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Batf3Q9D275 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Batf3Q9D275 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Batf3Q9D275 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Batf3Q9D275 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Batf3Q9D275 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms