Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ddx56Q9D0R4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ddx56Q9D0R4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ddx56Q9D0R4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ddx56Q9D0R4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ddx56Q9D0R4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ddx56Q9D0R4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ddx56Q9D0R4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ddx56Q9D0R4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ddx56Q9D0R4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ddx56Q9D0R4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ddx56Q9D0R4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ddx56Q9D0R4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx56Q9D0R4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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