Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms