Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc8Q9CYA6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zcchc8Q9CYA6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms