Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gins3Q9CY94 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms