Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mis12Q9CY25 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms