Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pin4Q9CWW6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms