Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snw1Q9CSN1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms