Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pard3bQ9CSB4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms