Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cdh23Q99PF4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cdh23Q99PF4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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