Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2ird2Q99NI3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms