Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ubqln4Q99NB8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms