Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pramel1Q99MW3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms