Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Atp1b4Q99ME6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms