Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprtQ99M80 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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PtprtQ99M80 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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PtprtQ99M80 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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PtprtQ99M80 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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PtprtQ99M80 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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PtprtQ99M80 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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PtprtQ99M80 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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