Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Sh3bp5lQ99LH9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Sh3bp5lQ99LH9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp5lQ99LH9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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Sh3bp5lQ99LH9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Sh3bp5lQ99LH9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Sh3bp5lQ99LH9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Sh3bp5lQ99LH9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms